不過即便是如此，在李晨芳面前，齊祖光也保持了足夠的尊敬姿態。如果說此前的作戰都是海軍艦隊說了算，那么接下來的戰爭指揮權便又回到了陸軍手中。作為荷蘭人在東南亞地區經營了十多年之久的要塞港口，從海上進攻顯然不是一個好主意，這也是巴達維亞堅持不投降的底氣所在。

而東協艦隊中能夠指揮這場陸戰的，便只有軍銜最高的陸軍上校兼日本大阪副總督的李晨芳了。東協艦隊中除了日本陸軍和大明陸軍這兩只成建制陸軍部隊之外，尚有英國、西班牙、葡萄牙拼湊出來了4個營，每營約500人。

李晨芳再檢閱完所有的陸軍部隊之后，便將英國人和葡萄牙人的兩營陸軍排除在了進攻巴達維亞的序列，在他眼中這兩營陸軍只是一些沒有經過系統訓練的民兵，難以使用在進攻要塞的戰場之上。

9月28日，毛利勝家帶著自己的聯隊坐船前往占領蘇拉威西島的重要港口望加錫，也就在同日，真田幸昌聯隊前往了東爪哇的泗水。一日后，一個西班牙營坐船前往了婆羅洲島南面的重要港口馬辰。

10月3日，東協艦隊主力出現在了三寶壟外的海面。到了10月17日，巴達維亞同外界的聯系已經全部被東協艦隊切斷。爪哇島西側的巽他海峽及東面的龍目海峽，也都已經被東協艦隊控制。

10月20日，在荷蘭人及東協之間搖擺不定的馬打藍蘇丹國的素丹·阿貢拉登·朗桑，再聽說了東協艦隊的船只充斥了從泗水到三寶壟之間的海面后，終于下定決心投靠了東協這邊，驅逐了巴達維亞派來拉攏他一起對抗東協的使者。

從中爪哇內陸發跡的馬打藍蘇丹國，此時還算不上一個封建集權國家，而更像是一個封建領主共治的社會。王國雖然領有中、東爪哇及西爪哇的一部分土地。但是國家的核心部分卻只有素丹的世襲領地克臘帕亞克、馬打藍、巴章和葛都等內陸地區，其他地區則由親王及貴族作為領主統治著。

拉登·朗桑再兩次進攻巴達維亞無果之后，對于奪回荷蘭人占去的西爪哇地區已經失去信心了。而此時看起來比荷蘭人更為強大的東協艦隊的到來，特別是爪哇島曾經的宗主國中國的到來，更是讓他不愿意加入到這場戰爭中去了。

拉登·朗桑雖然倒向了東協，卻也只肯負責支援艦隊的后勤工作，不肯派兵參加進攻巴達維亞的戰爭中去，顯然這位蘇丹對于東協的防備并不亞于荷蘭人。

不過對于東協艦隊來說，這位蘇丹能夠負擔艦隊的后勤已經足夠了。爪哇島土地肥沃，物產豐富，從當地獲取物資補給，無疑給艦隊減去了極大的負擔。

在本地人的幫助下，李晨芳很快率領軍隊打到了西爪哇的中心城鎮萬隆，此地以出產優良的勃良安劍而聞名。萬隆同時也是一處山間盆地，四周環繞著各種山峰及火山，因為地勢較高，這里的氣候終年在20多度，植物繁茂，環境優美，可算是爪哇島上難得的避暑盛地。

荷蘭人也在此處建立不少別墅，把這里當做了巴達維亞的后花園。不過現在么，這些別墅同樣成為了東協軍隊的戰利品。

戰爭打到了這個程度，東協軍隊面前也就剩下了一座巴達維亞城而已了。只不過巴達維亞城的位置實在是太好，周邊沼澤、山林密布，除了海上的通道之外，也就只能從東西兩面的道路進攻。

而西面的塔拉漢港同樣受控于荷蘭人手中，因此從陸地進攻的話，便只有東面一條道路可走。荷蘭人在這條道路上修建了20余座堡壘，這也是拉登·朗桑兩次進攻巴達維亞無果的緣由。

在萬隆的一座別墅內，李晨芳等陸軍軍官和艦隊船長們經過了一番討論之后，決定把軍隊分為兩路進攻。齊祖光帶著臺灣步兵團從海外進攻巴達維亞西面的塔拉漢港，而李晨芳率領剩下的軍隊從東面正面進攻荷蘭人的堡壘。

對于大阪第二師團來說，從加拉璜、西卡朗、勿加泗到雅加達城外的這一百里路程，簡直是用血肉鋪成的道路。困獸猶斗的荷蘭士兵，在初期戰斗中寧可點燃火藥桶和沖入堡壘的日本士兵同歸于盡，也不可向日本士兵投降。

西卡朗之戰中，荷蘭人引爆的火藥庫，讓整整一個大阪師團的步兵中隊炸上天后，站在后方觀戰的李晨芳終于看不下去了，他把指揮作戰的毛利勝家叫過來，在一干部下面前毫不留情的正正反反扇了他20多個耳光，把他的臉都打的紅腫了，才算是放過了他。

之后李晨芳親自接過了前線部隊的指揮權，下令在原地開始修整，并從艦隊上卸下了2門24斤重炮和4門12斤炮運到前線，這才算是徹底壓制住了荷蘭人依仗堅固堡壘的抵抗。于是戰爭很快變成了炮彈威力和堡壘堅固度的戰爭，日本士兵傷亡率終于降了下來。

不過即便是如此，打到雅加達城下的大阪第二師團也戰損了將近一個半聯隊，但剩下的部隊士氣反而更高昂了起來。至于江戶幕府的新軍雖然只損失了半個聯隊，但是卻完全被這樣殘酷的作戰嚇破了膽，李晨芳不得不將他們調到后方，讓他們負責后勤保衛的工作去了。

這些日本人的犧牲，終于得到了觀戰的東協成員們的認可，他們在看過了慘烈的戰場之后，終于同意了中國代表的意見，讓日本派出代表參加東協，成為東協的觀察國家。