他上疏劾諸將觀望，并將寧夏軍中所見一一上奏：“諸將心不一，但知忌功，不肯立功……諸將口雖唯唯，無有從者，由臣望淺權輕，不足懾服，坐辱君命，雖死無補。……諸將用兵不及游戲，因知從前捷報，盡屬欺罔。”

他奏折中還反應了平亂軍中缺少旌旗金鼓，各軍中缺少糧草，軍馬病餓死過半，特別重要的的是軍中缺箭。他還抱怨各將不聽自己的，讓自己不能全力任事：“臣之官為虛設，不若早賜罷斥，得離行間……”

看了梅國楨地彈劾奏折后，萬歷帝自然是大怒。此時原西北經略鄭洛也彈劾魏學曾幾點：擅啟邊隙，招撫玩寇，掩敗不報，舉止乖方。

朝臣方從哲也鼓動官彈劾魏學曾招撫劉東陽，許朝，停軍固原十日不進，坐失戰機。李渡河遲緩，松山，河套被韃虜所占，我軍被動。

到了這時，萬歷帝更是怒火不可抑止，當下下令免去魏學曾的督撫職，改由葉夢熊代領。不久后，又令錦衣衛將魏學曾逮捕入京。

萬歷二十年七月十七日，公元1592年8月24日。

經過城下近十萬官兵的努力，到了這天，環城大堤筑成，總長1700丈。剛好這天上午，朝廷圣旨到，罷秩魏學曾，命葉夢熊代之，也授予尚方寶劍。

由于事先朝廷已接到梅國楨的奏疏，彈劾諸將觀望。萬歷帝念師久無功。都是因為主帥紀律不嚴。調度失策，以至各將士皆不用命，奸誤國事。所以他下令將各路兵統于一，由總督統一調度，監軍專司監紀，無侵事權。

當時寧夏城下十二萬大明軍隊。分為了幾部，魏學曾統的西北四鎮為一部、甘肅巡撫葉夢熊為一部、李如松領的宣府、大同等鎮軍為一部。督撫、監軍各自為部，各有調兵權。此時城下的大明軍隊，才真正的指揮統一。

當天下午，新督撫葉夢熊召集魏學曾、朱正色、梅國楨，還有各鎮軍將們會議。葉夢熊與魏學曾大不相同，敢于殺伐決斷，連一向跋扈慣的李如松也懼怕他三分，不敢不前來聽命。

葉夢熊隨后整肅軍紀。頒布各種軍令，城下地十余萬大明軍士，無不是肅然聽命。

萬歷二十年七月二十一日。公元1592年8月28日。

葉夢熊下令決水灌城，立時茫茫大水向寧夏城撲去。城上叛軍惶恐一片，看著城外水位不斷高漲，城墻根上也不斷現出裂縫，堵都堵不住，城內的拜，李東陽等人都是手足無措。

拜急忙派養子克里益突圍去向河套地蒙古順義王力克求援。李如松得知后，命親將李寧追趕，斬克力益等二十九人級。拜求援未成。

拜不死心，隨后又派出部下攜帶黃金、繡蟒等財物，去向河套部地卜失兔求援，請他急往靈州，占據下馬關，阻隔官兵餉道。

這一次，拜聯系到了卜失兔。經過激烈的爭論后，卜失兔決定出兵，他與河套部的莊禿賴聯合。集兵三萬，分兩路增援拜。

一路兩萬人，由土昧、弭糾雷率領，進攻定邊、小鹽池。一路由打正率領，率一萬蒙古騎兵，從寧夏后衛花馬池西邊的沙湃口攻入，進攻官軍的側后。

新督撫葉夢熊得知幾萬蒙古兵來援拜地消息后，兵兩路反擊。

先他命令山西副總兵官黃來福，領著自己標下的二千三百人馬。還有寧夏副總兵官麻貴。領著自己標下的四千多人馬。二人合兵近七千，阻擊打正。二人還隨帶一些葉夢熊撥給的炮車相助。

此外葉夢熊判斷河套部幾萬人來援。定然是后方空虛，他派遣董一元率兵五千，乘虛出塞，定要搗其巢**。而且葉夢熊又派遣甘肅游擊龔子敬，提苗兵八百人堵在沙湃口，到時斷打正部地后路，并與出塞而回的董一元會合。

葉夢熊命令傳下后，眾人都是緊急行動起來。很快，黃來福和麻貴便集合自己標下的兵馬，南渡黃河，往靈州城方向而去。

說實在，此次出戰，是黃來福主動要求的，如果可以的話，他寧可與蒙古人野戰，也不愿意再進行那殘酷地攻城戰了，自己的精兵，不是無意義地消耗在那的。

看到黃來福這么積極，主動去和蒙古人作戰，城下各將都是驚訝，好好地在城下不好，去和蒙古人作戰？那可是兇多吉少，連李如松都很驚訝。當然，看到黃來福這么勇猛，葉夢熊當然是很高興，他大大地表揚了黃來福一番。

而聽說自家大人要領兵出寧夏城到外地作戰，五寨堡軍隊地各個將士們，從軍官到士兵，個個都是歡喜得嚎叫。這些天，在寧夏城下，眾人都是郁悶無比，這種攻城戰，真是沒一點意義，一點本領也施展不開，又拿不到軍功，各人只想著什么時候可以痛快地到野外撕殺。

此時機會來了，眾人個個都是摩拳擦掌，討論著將來自己可以斬敵多少，拿到多少級。這種好戰的樣子，看到城下別的軍隊眼中，又是一番感受。

這些天的攻城戰中，五寨堡軍隊損失150人左右，為了補充兵源，黃來福從五寨堡輜兵中，挑選了150人補充進來。這些輜兵，雖說精銳度比城下許多大明軍士要強，但卻沒有資格進入五寨堡軍隊戰兵營中，此時他們被選進來，個個都是歡喜。

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