幾年的合作，讓常薦新對谷甄云有了比較深刻的了解，而他對谷甄云的認識也算是比較到位。相對而，谷甄云這類中年人將領缺乏談仁皓與常薦新這類年輕將領所具備的積極進取的精神，也缺乏冒險精神。這些在戰場上就表現為谷甄云缺乏勇氣，缺少靈活應變的能力，以及把握機會的能力并不是很好。
到了第六特混艦隊后，谷甄云成為了特混艦隊司令官，也就是特混艦隊的一把手。與以往他擔任的艦隊參謀長不一樣，司令官需要對艦隊負全責，這也導致谷甄云在指揮作戰的時候更加的小心翼翼。用一句比較客觀的話來說，谷甄云是那種“不求有功，但求無過”型的將軍。
實際上，第六特混艦隊在到達了大西洋戰區的表現也正是如此。在編入了第二艦隊之后，谷甄云還兼任第二艦隊參謀長，為姜仲民的副手。雖然谷甄云與姜仲民之間并沒有任何直接的沖突，但是兩人的合作也不算是盡善盡美，主要就是兩人的指揮方式，以及對待戰爭的方式根本就是不一樣。在姜仲民想通過大西洋上的勝利建立起自己在海軍中的根基的時候，谷甄云卻僅僅只是希望第六特混艦隊不要出大問題，不要遭受慘敗。結果，兩人在前幾輪北上的時候就出現了矛盾。
德國“遠東艦隊”鬧別扭的那次，也就是姜仲明第二次被迫放棄北上，返回開普敦的那此作戰行動中，正是因為谷甄云在處理與“遠東艦隊”的聯合行動上出了問題，結果導致德國海軍上將舍爾對其嚴重不滿，最終導致整個遠征行動被迫終止。當時，舍爾要求“遠東艦隊”與第六特混艦隊先行北上攻打黃金海岸地區。因為天氣因素而無法參加作戰行動的第五特混艦隊則留在后方。從當時的情況來看，英國部署在黃金海岸地區的轟炸機并不是很多，如果“遠東艦隊”與第六特混艦隊先行北上，并且支援陸戰隊登陸的話，很有可能已經擊敗了該地區的英軍，為接下來進入大西洋中部海域打下了基礎。可谷甄云卻考慮到在沒有航母掩護下，戰列艦很容易遭到轟炸，結果就斷然拒絕了舍爾的提議，從而引發了兩國海軍之間的矛盾，最終即使天氣已經好轉，艦隊也不可能繼續北上了。
隨后，在攻打蒙羅維亞的戰斗中，谷甄云又與姜仲民產生了分歧。當時，英軍死守蒙羅維亞，陸戰隊久攻不下，因為后勤保障困難。艦隊的支援作用也沒有完全發揮出來。谷甄云早就提出暫時圍困蒙羅維亞，先分出一支部隊去打下佛得角群島，然后通過封鎖來迫使蒙羅維亞的英軍投降。后來第一艦隊的行動正好證明了谷甄云的判斷是正確的。而當時谷甄云并沒有意識到他的判斷很有遠見，只是在蒙羅維亞久攻不下的情況之下考慮到這一點的。可姜仲民堅持要先打下佛得角群島，為艦隊北上打開了通道，而且隨著第三艦隊進入加勒比海，后勤補給也得到了保證，艦隊北上進攻直布羅陀要塞的行動就易如反掌了。
從兩人之間的這些矛盾中可以看出，姜仲民與谷甄云之間的合作并不怎么樣。特別是在攻打蒙羅維亞的時候，姜仲民還把事情鬧到海軍司令部。最后由聶人鳳親自發來電報，再次確認了姜仲民與谷甄云之間的關系。雖然聶人鳳沒有在電報中直接批評谷甄云，但是這個在海軍中混了十幾年才出頭的中年將領很清楚，姜仲民是海軍元帥的學生，如果他繼續與姜仲民發生沖突的話，海軍元帥肯定是在姜仲民那邊的。因此，在后來的作戰行動中，谷甄云就很少表達自己的獨立見解，而是姜仲民叫他干什么，他就去干什么，從不積極，主動的參加作戰行動。而這正好也是谷甄云的性格。
艦隊到了直布羅陀要塞之后，第一艦隊與第二艦隊會師，新的指揮關系確定了下來，談仁皓為兩支主力艦隊的聯合司令官。雖然新的指揮體系很明確，但是“聯合艦隊司令官”只是一個臨時性的戰斗職務，在海軍的指揮體系中沒有沒有明確的位置。而且這只是姜仲民與談仁皓之間的關系。谷甄云仍然是第二艦隊參謀長，第六特混艦隊司令官。其仍然向姜仲民負責。也就是說，如果談仁皓要給第六特混艦隊下達作戰命令的話，那還得通過姜仲民那一關，至少要得到姜仲民的默認。而當姜仲民與談仁皓下達的命令有矛盾的時候，谷甄云則應該聽從姜仲民這個直接上級的指揮，而不是聽從談仁皓的指揮。這至少是谷甄云本人對這次聯合作戰的理解，而且也正是這個理解，最終導致第六特混艦隊在二十二日下午到二十三日清晨的作戰行動中一波三折。
當天下午，谷甄云收到了同樣的情報，隨即他就按照談仁皓之前的戰役部署，率領第六特混艦隊離開了奧爾德尼島附近海域，向凱爾特海方向而去。按照談仁皓的部署，到時候將由第三特混艦隊與第六特混艦隊在凱爾特海南部海域組織起一條防線，負責搜索與攔截英國海軍的戰列艦艦隊，同時，第一特混艦隊與第五特混艦隊則負責尋找與打擊英國海軍地航母特混艦隊，第二特混艦隊為戰役預備隊，同時負責為第三特混艦隊與第六特混艦隊提供防空掩護。可谷甄云忽略了一點，那就是這套作戰計劃是針對英國本土艦隊是從愛爾蘭海方向進入戰場，而不是從多佛爾海峽方向進入戰場而制訂的。同時，他還忽略了當時的戰局變化，沒有主意到，已經有很多情報證明薩摩維爾率領的戰列艦艦隊不打可能在愛爾蘭海，而是很有可能在夜間通過多佛爾海峽進入英吉利海峽！
在收到了談仁皓的命令后，谷甄云沒有立即回電，結果導致第一特混艦隊一直在設法聯系上第六特混艦隊，電報反復的拍發了數十次！這也只能說是谷甄云與談仁皓在這個時候都犯了錯誤。谷甄云犯的錯誤是盲目的執行之前制訂的作戰計劃，而沒有考慮到第一特混艦隊為什么要反復不斷拍發電報，也沒有想到要給第一特混艦隊回電，而是一直保持著無線電靜默！談仁皓的錯誤也很明顯，他在電報中一直用的是“商量”的口吻，而不是“命令”的口吻。其實，在此之前，談仁皓的主要就是與常薦新，郝東覺，黃曉天等人合作，而在與這些人聯合作戰的時候，談仁皓是不需要在電報中用“命令”口吻的，可谷甄云并不是談仁皓的“同道”，因此，當談仁皓用“商量”的口吻發出電報的時候，谷甄云還意味談仁皓并沒有修改作戰計劃呢！
也正是如此，谷甄云沒有用電臺與其他特混艦隊聯系，只是在下午的時候派遣水上飛機去了第一特混艦隊，第三特混艦隊，以及第五特混艦隊，向談仁皓，常薦新與姜仲民匯報了第六特混艦隊的行動情況。可沒有能夠返回戰場，反而向著海峽外航行了數十海里，幾乎就要徹底的脫離戰場了！