鄭芝龍對于這次行動也是心滿意足，此次從長崎、平戶中奪取的財富，有將近十分之一落入了他的口袋，而且他還接回了妻子田川氏和兩個兒子一個女兒。

十一月十五日，普特曼斯帶著主力艦隊繼續北上，十六日抵達了福岡城北面的海面，和加藤忠廣形成了海陸合圍的勢態。黑田忠之這才手忙腳亂的放棄了中立的主張，表示愿意加入倒幕聯軍。

十一月十七日，艦隊抵達了小倉城，接受了細川忠興的投效，至此九州島的幕府勢力基本被清除。同九州島隔著一道海峽的長州藩上下固然是大喜，但是對于四國島上的土佐藩來說卻是一個噩耗。

更讓土佐藩上下憂心的是，十一月十五日，在紀伊水道發生了一場水戰，德島藩和紀伊藩的水軍不敵明人艦隊，最終喪失了紀伊水道的控制權，瀨戶內海航道陷入了明人艦隊的威脅之下。

四面環海的四國島，失去了海上航道的控制權，等于要獨立面對九州聯軍的進攻，這讓土佐藩陷入了緊張備戰和惶恐不安的氣氛之中。

不過在水戰中失利的德島藩和紀伊藩，情緒卻比土佐藩穩定多了。在水戰一開始就拋棄了盟友，逃回根據地的淡路水軍基本沒有受到什么損失。

蜂須賀家政此前同東海巡閱府暗中達成的協定，使得德島藩不僅沒有受到明人艦隊的進攻，反而使得德島城成為了明人艦隊的補給港。

至于紀伊藩，原本就沒有什么實力的水軍被殲滅，并不能損害到紀伊藩的實力，藩內領地上缺乏優良港口，也避免了明人艦隊從海上的入侵。

藩主德川賴宣和家臣們，卻從這場水戰中意識到了德島藩的不可靠和明人艦隊的強大。賴宣和家臣們討論再三之后，決定無視幕府要求他們出擊大阪的意見，并不答應大阪方面的停戰協議，先保住自家的安全再說。

十一月十七日，德川賴宣偽裝成安藤直次的侍衛，在堺市和李晨芳、許心素進行了一次會談。會談中李晨芳、許心素向賴宣承諾，不管日后形勢如何變化，明國都會確保其對于紀州半島的統治權力，并將王子川-鶴田湖-狹山以南的區域交給紀伊藩。

賴宣則承諾，只要幕府軍沒有奪取大阪城，紀伊藩就會保持中立，絕不會出兵越過王子川-鶴田湖-狹山一線。除此之外，賴宣還掏出了5萬兩，贖回了被俘的紀伊藩將士，并購買了一批武器。

阿部正次帶著返還的長州討伐軍剛剛奪下了兵庫津，就遭到了停泊在港外的五艘戰艦的炮擊。被打的潰不成軍的片岡支隊趁機退往來了六甲山，而兵庫津及港口卻徹底被摧毀。

介于明人艦隊控制了海上航道，阿部正次不得不止步于湊川以西。因為他擔心自己率軍進攻大阪時，這只艦隊會截斷他的后路，讓他這只部隊處于前后夾擊之中。

阿部正次雖然停下了腳步，但也沒有呆在原地發呆。他一邊派人同艦隊交涉，詢問對方為何無故攻擊本軍，一邊派出了小股部隊對流竄于六甲山一帶的片岡殘軍進行圍剿。

此外，他還派出了信使前往京都，請求京都所司代板倉重宗帶領召集來的京畿聯軍南下，和自己一起進攻大阪。

而在此時，葉雨軒正將聯軍指揮部從種子島遷往長崎，并邀請九州諸藩及長州藩等西國大名在長崎會面，商討聯軍上洛一事。也就在這個時候，由**三道水使林慶業帶領的六、七十艘運輸船，正浩浩蕩蕩的向著長門開去。

這座長州藩著名的漁港，現在已經成為了日本以西最大的捕鯨基地。大明的漁業公司在此地不僅控制著大批人手，還儲備了大量的糧食，足以支持一只艦隊的消耗。

林慶業將濟州第一步兵團運來此處，也是想要借助此地的物資支持北上的作戰計劃。就在西南諸藩和聯軍緊張籌備著上洛作戰時，京都所司代板倉重宗卻陷入了麻煩之中。

阿部正次的出兵計劃雖然很好，但是板倉重宗卻感覺自己無能無力。因為京都正陷入了物資缺乏的難題，他甚至都不得不中止了向京畿各藩征召軍隊的命令。

按理說，坐擁京都盆地和臨近大阪平原的京都，其實不應該缺乏物資。但是數十年的和平，使得京都人口已經超出了京都盆地能夠承載的人口上限，基本上都需要從大阪輸入各種生活物資。

但是現在大阪淪陷，而此前秋收的一部分糧食又被調撥給了阿部正次，這使得京都一下失去了物資輸入的來源。板倉重宗雖然有意向彥根、尾張兩藩求助，但是前者也就意思意思的送來了500石糧食，而后者則干脆一毛不拔。

在大阪出動軍隊做出進攻京都的舉動后，又有不少人從京畿附近逃入了京都，更是加快了消耗京都物資的速度。在這樣的狀況下，板倉重宗能夠安撫住京都不發生變亂就不錯了，哪里還能領兵出征大阪呢。