逃到了庫車城的阿布都拉哈汗并不認為自己是安全的，在明軍面前已經逃了兩次的他，心態已經完全失去了平衡，現在只想跑去一個明軍難以追擊到的地方好重整旗鼓。

他抵達庫車后不久，便一度想要退往庫車東北方的別失八里，即天山中段南麓、卻勒塔格山北緣的山間盆地、渭干河上游的流域。不過跟著他逃到庫車的伯克和軍隊卻不愿意了，庫車城瀕臨平原農業帶尚有倉儲積蓄可用，別失八里則大多是山區，既無城墻可以防備敵人，也無糧食養活這么多人。

阿布都拉哈汗繼續往山里逃亡，無疑就是要伯克和軍隊丟下自己的家眷。再加上冬季已經到來，天山中的大雪下起來，那可是殺人于無形的存在。

在這些伯克和士兵們的鼓噪下，就連阿布都拉哈汗的親信也不敢勸說他繼續逃亡了。眼看有爆發兵變的危險，阿布都拉哈汗不得不親自出面召見伯克們，宣稱他并沒有意思繼續逃亡，而是打算在這里和明蒙聯軍決一死戰。

為了表明他的決心，阿布都拉哈汗隨即下令征集庫車周邊的人丁前來庫車，擴充軍隊準備備戰，這才算是將軍中將士的不穩定情緒給壓制了下去。

11月23日，阿布都拉哈汗收到了鐵門關失守，明蒙聯軍約15000人通過了鐵門關向著庫車浩浩蕩蕩而來的消息。到了這個時候，他不得不向弟弟伊卜喇伊木王子妥協，不再試圖奪取阿克蘇軍隊的指揮權，而是要求他帶著軍隊前來保衛自己。

12月5日，伊卜喇伊木王子帶領一萬二千大軍抵達庫車西郊，這總算讓庫車的軍民們安心了不少。不過伊卜喇伊木王子進城拜見了兄長后，卻提出要在野外殲滅敵人的計劃。

伊卜喇伊木王子當著兄長及眾多伯克面說道：“…我軍北上者一萬二千，吉爾吉斯人前來援助汗者三千余人，庫車加上各城而來的援軍也有近2萬之眾。

我軍現在有3、4萬人，而明蒙聯軍不及我軍一半，他們又不熟悉地理，所以行軍緩慢。等他們到了庫車的地面，正是隆冬時節，大軍長途跋涉又遇到氣候寒冷之季節，戰斗力還能剩下幾成？

我軍若是出城迎戰，正是符合了以逸待勞，以眾擊寡的優勢。反之，若是縱容明蒙聯軍在城外越冬，等到明年開春之后，天知道還會不會有明軍的援軍和他們匯合？

此外，庫車不是阿克蘇和庫爾勒，此地有這么多積蓄供應我們這么多軍隊和居民度過這個冬季嗎…”

伊卜喇伊木王子提出的主張，頓時讓參加會議的伯克們小聲的討論了起來，阿布都拉哈汗也是有些遲疑不決。

就在這個時候，被他招募而來的吉爾吉斯人的首領克力奇·夏米爾罕諾夫站了出來，向著行禮后說道：“汗王，我覺得伊卜喇伊木王子說的對，打仗憑借的就是將士們的勇氣。

現在我軍人數是敵軍的一倍，他們又是遠道而來的疲憊之師，如果這樣我們還要守在城內等他們來攻，將士們的勇氣必然會大受損害，到時便是有城墻遮擋敵人的弓箭，但是沒有了勇士把守的城墻又怎么抵擋的住敵人的進攻呢？

如果汗王堅持要守城的話，那么我們吉爾吉斯人倒是愿意跟隨伊卜喇伊木王子前去進攻明蒙聯軍，去冒一冒這個風險…”

吉爾吉斯人的話語，頓時激起了一部分伯克們的不忿。作為東察合臺汗國的繼承者，葉爾羌汗國的伯克們可一直都是看不起曾經的察合臺汗國的奴隸吉爾吉斯人的。

直到今天，吉爾吉斯人也沒能建立起一個屬于自己的國家，還只是一群在山間放牧的游牧部族聯盟，不僅被周邊的布哈拉汗國、哈薩克汗國、衛拉特、葉爾羌汗國欺壓著，就是他們自己內部還存在諸多的矛盾，什么平原部族和山區部族之分，什么外姓部族和內姓部族之分，什么三十姓部族和九姓部族之分。

在葉爾羌人眼中，就是衛拉特人都是蠻夷，更不必提這些連蠻夷都算不上的雜胡了。因此克力奇·夏米爾罕諾夫辭中流露出來的輕視態度，頓時讓這些伯克們惱羞成怒了起來。

他們或是訓斥克力奇·夏米爾罕諾夫無禮，在葉爾羌的宮廷內胡亂發，或是向著阿布都拉哈汗請愿，請求汗王帶領他們出城迎戰。

阿布都拉哈汗雖然對弟弟當眾挑戰自己權威的舉動極為惱火，但是在這群情洶涌的狀況下，他也不敢一口回絕，只能說先派人打聽清楚明蒙聯軍的動向再做決定。

探子很快就送回了消息，明蒙聯軍停駐在了庫車200里外的輪臺地區，聯軍在那里大舉砍伐胡楊搭建營壘，顯然有在當地越冬的意思。

這個消息頓時讓庫車城內的伯克們大為驚慌了起來，顯然伊卜喇伊木王子的判斷是對的。明蒙聯軍不急于進攻庫車，也就意味著他們在開春時將會迎來一只養精蓄銳的敵軍。

阿布都拉哈汗不得不認同了出城迎戰的計劃，這個時候他自然是不敢再將軍權全部交給自己的兄弟了，于是他決定親自掛帥出征。

為了確保萬無一失，阿布都拉哈汗將庫車城內外的兵力全部都帶上了，雖然不及當初出征喀什噶爾的五萬大軍之多，但也達到了三萬八千余人。

12月25日，阿布都拉哈汗軍抵達輪臺，明蒙聯軍也迅速集結了起來，雙方最終在輪臺城外西北方20里處的丘陵夾雜平原的地帶列陣對峙。

阿布都拉哈汗軍位于西北方的高地，明蒙聯軍則位于東南方的平原。從地理上看，聯軍還是吃了不少虧的。不過西北方有著更多的丘陵，因此阿布都拉哈汗軍只能排列成密集的陣線，而東南方廣闊的平原倒是讓以騎兵為主的聯軍散開了隊形，算是讓聯軍扳回了一點地利。

阿布都拉哈汗自己帶著2萬大軍居于中間，他的左翼是伊卜喇伊木王子率領的1萬2千阿克蘇軍，他的右翼是吉爾吉斯人和布古赤伯克率領的葉爾羌騎兵，共計六千人。