順義王不他失禮很快就回復朝廷，愿意配合朝廷穩住蒙古諸部的局勢，其實三娘子和不他失禮很清楚，朝廷收回活佛繼承的權力，對于像順義王這樣的世系蒙古王公來說是很好的，這樣可以有效的抑制宗教勢力的過度膨脹，使得這些王公們的權力更加穩固，這點他們還是很清楚的，所以他們當即上疏朝廷，表示愿意配合朝廷。

這點朱載j也是很清楚的，在穩住了蒙古之后，朱載j的重心就在青藏的這些土司和活佛身上了，尤其是哲蚌寺這樣在藏區有很大影響力的寺院，都是朱載j非常重視的，朱載j首先以上諭的形式明確了大明和西藏的關系，朱載j在上諭中明確說道：“番人也是朕之赤子，番人地方都是祖宗開拓的封疆。”

也就是肯定烏斯藏乃是大明的領土這個不容辯駁的事實，對于這點，朱載j是極為重視的，這點是大明經略烏斯藏的核心，雖然現在大明可以以羈縻的方式承認烏斯藏地方政權的合法性，但是在涉及到朝廷根本利益的問題上，大明是不容挑釁的，這點朱載j希望烏斯藏的頭人、活佛要清楚。

同時朱載j也明白，烏斯藏的這些活佛和大明皇室的關系其實也是很親近的，格魯派創始人宗喀巴大師曾上書成祖皇帝一封書信，在書信中將明朝皇權置于其教權之上，稱頌成祖皇帝“政令嚴明，為各邦所悅服”。他所意指的各邦就是烏斯藏內部各政教勢力，顯然身居雪域中土的格魯派也屬其中一支，并欣然接受大明管轄。

武宗皇帝還曾經召集了很多的番僧，這些都說明了大明和這些烏斯藏地方勢力的關系，同時在經濟上的往來也是很重要的，同時朱載j還和重臣們一道回顧了大明對于烏斯藏的治理方式，其實這個治理方式是從太祖時就確定下來的，就是多封眾建，羅萬化就說道：“陛下，太祖以西番地廣，人獷悍，欲分其勢而殺其力，使不為邊患，故來者輒授官。”

成祖也繼承了太祖皇帝的這個措施并加以調整，成祖主要是建立了僧官制度，諸衛僧戒行精勤者，多授喇嘛、禪師、灌頂國師之號，有加至大國師、西天佛子者，悉給以印誥，許之世襲。可以說現在在烏斯藏有頭有臉的所謂法王、活佛，基本上都是太祖、成祖、武宗三朝所冊封的，這樣的大規模冊封，使得烏斯藏的各種勢力極多，無法形成對中原有威脅的力量，同時在各方政教勢力的斗爭中，不可避免的的要與外來的勢力相勾結才能夠使得自己的教派得以發展。

這點在格魯派身上就很明顯，原本格魯派并不是烏斯藏的大教派，格魯派的第一代活佛宗喀巴大師規定僧人必須斷絕與世俗社會的聯系，嚴守戒律，不可逾矩，需在寺院中清凈修行。這些舉措得到了烏斯藏地方政權的支持，格魯派才得以壯大，但是面對其他教派的打壓，格魯派也必須尋找盟友。