摸清了東林黨的底牌和目的，朱由檢心中反而踏實了不少。只要不是勾結外敵、圖謀造反，單純的朝堂權力博弈，他自信還能掌控。他深知“水至清則無魚”的道理，完全將東林黨排除在官場之外既不現實，反而可能激化矛盾，讓他們狗急跳墻，轉而與流寇、外敵勾結；但若放任他們滲透核心崗位，又會阻礙新政推行，重蹈黨爭誤國的覆轍。

權衡再三，朱由檢定下了“制衡有道”的策略：在非核心、不影響新政與軍事推進的崗位上，適度默許東林黨的人事推薦，既安撫其情緒，又讓他們有存在感；同時牢牢把控內閣、六部侍郎以上高官、重要督撫、軍事與財政核心崗位的任免權，絕不讓東林黨染指關鍵權力。

接下來的日子里，東林黨果然開始在中低層官職任免上發力，陸續推薦了數十名人選——既有翰林院編修、都察院御史等清流官，也有江南、湖廣等地的知府、知州、學官，還有漕運、鹽鐵系統的佐貳官。朱由檢逐一審視這些推薦名單，仔細甄別：

對于松江府學教授、杭州府推官等不涉及核心權力的崗位，他大多予以批準，既滿足了東林黨的部分訴求，又不影響新政推進；對于漕運總督佐貳官、湖廣布政使司參政等涉及錢糧、地方治理的崗位，他則果斷駁回，理由是“人選資歷不足”“需優先啟用熟悉新政之人”；對于翰林院編修等清貴崗位，他批準了部分人選，但同時提拔了同等數量的新政派生員，保持翰林院內部的勢力平衡。

東林黨見部分推薦得到批準，果然收斂了之前的激進態度，行事變得更有章法和耐心。他們不再強求核心崗位，而是專注于鞏固已獲得的職位，通過這些崗位傳播自身理念，培養門生故吏，試圖緩慢擴大影響力。朝堂之上，漸漸形成了一種微妙的平衡：東林黨在文化、禮制、中低層地方治理等領域發聲，新政派掌控軍事、財政、核心政務，雙方偶爾爭論，卻不再出現此前的激烈對抗。

朱由檢則一邊冷靜觀察這場無聲的滲透與反滲透游戲，一邊加快新政推進：李巖帶領的稅務稽查隊已在河南、山東清查出萬余畝隱匿田產，追繳欠稅十余萬兩；登萊海貿的關稅收入持續增長，每月穩定在五十萬兩左右，為山西練兵、陜西賑災提供了充足資金；京營在李邦華的整頓下，器械補充完畢，訓練成效顯著，士兵戰力大幅提升。

就在這微妙的平衡中，陜西傳來了捷報。孫傳庭接到朱由檢的密旨后，立刻調整策略，集中兵力針對陜西境內最大的流寇勢力——王二部。王二是陜西流寇的頭目之一，聚眾萬余人，盤踞延安府一帶，燒殺搶掠，無惡不作，此前多次擊敗地方官軍，氣焰囂張。

孫傳庭并未急于強攻，而是先派細作潛入流寇內部，分化瓦解，策反了王二麾下的兩名頭領；隨后按照密旨方略，集中精銳官軍，直搗王二的老巢；同時安排地方官府在沿途設卡，阻斷流寇退路。激戰三日，官軍大破流寇，王二被生擒，其麾下三千余核心匪眾被斬殺，其余七千余被裹挾的從犯，按朱由檢的旨意，編為“工役營”，派去修繕涇河沿岸的水利設施。

幾日后，驛卒快馬送來了捷報，同時呈上的還有王二的人頭。孫傳庭在奏疏中詳細匯報了剿匪過程，稱“按陛下密旨，首惡已除，從犯已編為工役，涇河水利修繕已啟動，陜西境內流寇主力基本肅清”。

朱由檢看著捷報，心中大悅。孫傳庭的勝利不僅穩固了陜西局勢，更印證了他“剿撫結合、以工代罰”策略的可行性，同時也震懾了朝堂上的東林黨——新政派重臣不僅能推行改革，更能安定地方，他們的地位絕非輕易可撼動。

他當即下旨：“孫傳庭剿匪有功，賞白銀千兩，綢緞百匹，加太子少保銜；參與剿匪的官軍將士，按軍功大小封賞；編為工役的從犯，若服役期間表現良好，可減免半年苦役。”

這道旨意既表彰了功臣，又體現了仁政，很快通過《大明周報》傳遍天下。東林黨見新政派政績斐然，果然收斂了進一步的動作，朝堂上的爭論也愈發克制，微妙的平衡得以維持。

御書房內，朱由檢看著墻上的輿圖，手指劃過陜西、山西、江南等地，眼中閃爍著堅定的光芒。他知道，這場權力博弈遠未結束，東林黨絕不會輕易放棄滲透，未來還會有新的挑戰。但只要他始終保持清醒，堅持“制衡有道”的策略，牢牢掌控核心權力，同時依靠新政派的實干穩住大局，就能在這場漫長的博弈中占據主動。

虛驚一場的“陰謀”最終化為一場常規的權位之爭，朱由檢以高超的政治智慧化解了潛在的危機，既沒有激化矛盾，又守住了新政的底線。而孫傳庭剿平王二的勝利，更讓大明的中興之路多了幾分底氣。接下來，他要做的，便是繼續推進新政，充盈國庫，強化軍力，為應對更大的風浪做好準備。

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