元始三年（公元3年）春天，太皇太后派長樂少府夏侯藩、宗正劉宏、尚書令平晏，帶著禮物去察看王莽女兒。回來后，他們上奏說：“安漢公的女兒自幼受道德教化熏陶，容貌美好嫻靜，正適合承天命、奉祭祀，當皇后再合適不過。”太師孔光、大司徒馬宮、大司空甄豐、左將軍孫建、執金吾尹賞，以及代理太常事務的大中大夫劉秀，還有太卜、太史令，都頭戴皮弁，身穿素積，依照禮儀，綜合運用占卜和筮法進行測算，都說：“占卜的兆象顯示金水相生，處于王相之位；卦象顯示父母得位，這是健康強壯、吉祥如意的征兆。”隨后，又用太牢之禮（牛羊豬三牲齊全）在宗廟進行祭告。
有關部門上奏：“按照舊例，聘皇后需用黃金二萬斤，折合成錢是二萬萬。”王莽卻極力推辭，只接受了六千三百萬，還把其中的四千三百萬分給了十一位陪嫁女子的娘家，以及自家九族中的貧苦人家。
這年夏天，安漢公王莽奏請制定車輿、服飾等一系列制度，涵蓋官吏百姓的日常生活、喪葬嫁娶，以及奴婢數量、田宅規格、日常器具等方面的等級標準。同時，提議設立國家的稷神祭壇，并要求郡國、縣邑、鄉鎮都要設立學校。
大司徒司直陳崇，讓張敞的孫子張竦起草奏章，極力稱贊安漢公王莽的功德，提議：“應該擴大安漢公的封國，如同當年周公；封立他的兒子，如同當年伯禽，賞賜的規格也都應相同，他其他兒子的封爵，也都要比照周公六個兒子的標準。”太皇太后把奏章拿給眾公卿看。眾公卿正商議此事時，呂寬事件突然爆發。
起初，王莽的長子王宇反對父親隔絕衛氏家族，擔心日后會招來災禍，就私下與衛寶通信，讓衛太后上書謝恩，趁機陳述丁氏、傅氏家族從前的惡行，希望能借此機會到京城來。王莽稟告太皇太后后，太皇太后下詔，褒獎中山孝王后，給她增加七千戶食邑。衛太后日夜哭泣，一心想見皇帝一面，可得到的只是更多食邑。王宇又讓她上書請求入京，王莽堅決不同意。
王宇與老師吳章，還有妻子的哥哥呂寬商議此事。吳章認為王莽聽不進勸諫，但迷信鬼神，可以制造怪異現象嚇唬他，然后再順勢勸說王莽把權力歸還給衛氏。于是，王宇就讓呂寬在夜里把狗血灑在王莽家門口，結果被官吏發現。王莽將王宇抓進監獄，逼他服毒自盡。王宇的妻子懷了孕，也被關在獄中，等她生下孩子后，便將她殺害。
甄邯等人稟告太皇太后，太后下詔說：“安漢公身處周公之位，輔佐年幼的皇帝，卻能像周公誅殺管叔、蔡叔那樣，不因為私情而損害大義，我非常贊賞！”王莽趁機將衛氏家族成員全部殺光，只留下了衛太后。吳章被腰斬，尸體在東市門口被分裂示眾。
吳章原本是當時的著名儒者，門下弟子眾多，有一千多人。王莽卻認為他們是惡人的同黨，一律禁止他們做官。這些弟子為了避禍，紛紛改拜其他老師。平陵人云敞當時擔任大司徒掾，主動上書表明自己是吳章的弟子，收殮吳章的尸體抱回家中，裝棺下葬，京城的人都稱贊他的義舉。
王莽借著呂寬案件，大肆追查所謂的同黨，把平日里厭惡的人全都牽連進來，一并誅殺。元帝的妹妹敬武長公主，向來與丁氏、傅氏交好，王莽專權后，她又多次非議王莽；紅陽侯王立，是王莽的長輩；平阿侯王仁，向來剛直不阿。王莽都假托太皇太后的詔書，派使者逼迫他們自盡，卻稟告太后說公主是突然暴病而亡。太后想去吊喪，也被王莽極力勸阻。
甄豐派使者乘坐驛站馬車，查辦衛氏黨羽。各郡國的豪杰，以及朝中忠誠正直、不愿依附王莽的大臣，都被誣陷罪名而慘遭殺害。何武、鮑宣，還有王商的兒子樂昌侯王安，辛慶忌的三個兒子護羌校尉辛通、函谷都尉辛遵、水衡都尉辛茂，南郡太守辛伯等人，都因此喪命。此次事件死者多達數百人，舉國震驚。北海人逄萌對朋友說：“君臣、父子、夫妻之間的倫理綱常都斷絕了，再不走，災禍就要降臨到自己頭上！”于是，他摘下帽子掛在東都城門上，回到家中，帶著家屬渡海，到遼東去隱居了。
王莽把精通禮儀的少府宗伯鳳召來，讓他講解過繼他人為后嗣的道理，還讓公卿、將軍、侍中及朝中大臣都來聽講，表面上是想在朝廷內部教育天子，實際上是想堵住百姓的悠悠之口。
在此之前，秺侯金日磾的兒子金賞、都成侯金安上的兒子金常，都因為沒有兒子，封國被廢除。王莽讓金日磾的曾孫金當、金安上的孫子京兆尹金欽，繼承他們的封爵。金欽卻認為：“金當應該為他的父親、祖父立廟，讓大夫主持對金賞的祭祀。”甄邯當時也在場，在朝堂上大聲斥責金欽，還彈劾他：“金欽誣蔑祖先，不孝且大不敬。”金欽被投入監獄，zisha身亡。甄邯因維護朝綱，不徇私情，忠孝表現尤為突出，被增加封邑一千戶。朝廷又封金安上的曾孫金湯為都成侯。金湯受封當天，都不敢回家，以此表明過繼為后嗣的大義。
這一年，尚書令潁川人鐘元擔任大理。潁川太守陵陽人嚴詡，原本憑借孝道做官，他把下屬官吏當作師友，下屬犯了過錯，他就關起門來自我責備，從不大聲斥責。結果郡里一片混亂。王莽派使者征召嚴詡，幾百名下屬為他設宴送行，嚴詡卻坐在地上痛哭。下屬們說：“大人您是得到了吉利的征召，不該這樣啊。”嚴詡說：“我是為潁川的百姓難過，哪里是為自己擔憂！我因為性格柔弱被征召，朝廷一定會選派嚴厲剛猛的人來接替我；等新人一到，恐怕就會有人要遭殃了，所以我才為他們哀悼。”嚴詡到京后，被任命為美俗使者。朝廷又調隴西太守平陵人何并擔任潁川太守。何并一到任，就逮捕并斬殺了鐘元的弟弟鐘威，以及陽翟的惡霸趙季、李款，潁川郡上下震驚恐懼。
元始四年（公元4年）春天正月，在郊外祭祀高祖劉邦，讓他配享上天；在宗廟祭祀漢文帝劉恒，讓他配享上帝。把殷紹嘉公改封為宋公，把周承休公改封為鄭公。
朝廷下詔：“婦女只要不是親自犯法，男子年齡在八十歲以上、七歲以下，只要家中不是犯了大逆不道之罪，或者不是詔書點名逮捕的，都不得拘禁；如果確實需要查問，就在家中進行。將此規定定為法令！”
二月丁未日，朝廷派大司徒馬宮、大司空甄豐等人，帶著皇帝專用的車駕，到安漢公府迎接皇后，授予皇后璽綬，迎入未央宮。隨后大赦天下。
朝廷派太仆王惲等八人，各自配備副手，持符節，分別巡視天下，考察各地風俗民情。
夏天，太保王舜等人，以及八千多名官吏百姓上書，都請求按照陳崇之前的提議，對安漢公王莽進行嘉獎。奏章下達給有關部門，有關部門提議：“給安漢公增加新息、召陵兩縣，以及黃郵聚、新野的田地作為封邑；采用伊尹‘阿衡’、周公‘太宰’的稱號，加封安漢公為宰衡，位居上公；三公向安漢公匯報事情，要稱‘敢之’；賜安漢公的母親尊號為功顯君；封安漢公的兩個兒子王安為褒新侯，王臨為賞都侯；增加皇后聘禮三千七百萬，加上之前的，一共達到一萬萬，以此彰顯立后大禮；太后親臨前殿，親自進行封拜，安漢公在前面拜謝，兩個兒子在后面拜謝，一切都仿照當年周公的舊例。”
王莽磕頭推辭，上奏章說：“我只愿接受給母親的尊號，退回王安、王臨的印信綬帶，以及他們的封爵、封邑。”事情又交給太師孔光等人商議，他們都說：“這些賞賜都不足以報答安漢公的功勞。謙讓節儉是安漢公一貫的作風，但這次千萬不能聽從他的推辭。忠臣為了君主的大義，也應該委屈自己。應該派大司徒、大司空持符節，奉皇帝詔令，讓安漢公趕緊入朝處理政務，同時詔令尚書，不再接受安漢公的辭讓奏章。”奏章得到批準。王莽這才出來處理政務，但只減少了召陵、黃郵、新野的田地賞賜。
王莽又把增加的聘禮錢拿出一千萬，贈送給太后身邊侍奉的人。王莽雖然獨攬大權，但為了討好太后，用盡各種手段，就連太后身邊的侍從，他也千方百計地賄賂，贈送的錢財數以千萬計。他還稟告太后，尊稱太后的姐姐、妹妹為君，賜給她們食邑。因此，太后身邊的人日夜都在稱贊王莽。王莽深知太后是個婦人，厭煩長期深居宮中，為了取悅太后，換取她的支持，就安排太后四季乘車到京城四郊巡游，看望孤兒、寡婦和貞婦。每到一個屬縣，就廣施恩惠，賞賜百姓錢財、布帛、牛肉和美酒，每年都如此。太后身邊一個玩耍的孩童生病了，住在宮外，王莽還親自去探望。他就是這樣想盡辦法討太后歡心。
太保王舜上奏說：“天下人聽聞安漢公不接受封土，推辭萬金聘禮，無不向往效仿。蜀郡男子路建等人原本在打官司，如今都停止訴訟，滿懷慚愧地退去。就算是當年周文王化解虞、芮兩國爭端，也不過如此！應該把這件事通告天下。”太皇太后批準了這一奏請。此時的孔光愈發恐懼，堅決稱病要辭去官職。太后下詔：“太師不必上朝，每十天進宮一次，安排坐榻、手杖，賞賜十七種食物，然后回家，屬官各按職責行事。”
王莽奏請修建明堂、辟雍、靈臺，為求學的人建造一萬間房舍，規模宏大。他還設立《樂經》博士；增加博士名額，每一經設置五名博士。征召天下精通一門技藝、能教授十一人以上，以及通曉失傳的《禮經》、古代典籍、天文、圖讖、樂律、月令、兵法、文字學的人，都到公車署報到。王莽借此網羅天下奇才異能之士，先后有上千人到來，他讓這些人在朝廷中陳述見解，意圖糾正謬誤，統一各種學說。
朝廷又征召上百名治理黃河的能人，其中見解各異。長水校尉平陵人關并說：“黃河決口常在平原、東郡一帶，因為這里地勢低洼，土質疏松。聽說大禹治水時，就特意空出這片區域，水大時讓它自然漫溢，水少時又能自行干涸。雖河道常有變動，但始終沒離開這一區域。上古之事難以考證，不過觀察秦漢以來，黃河在曹、衛舊地決口，南北決口范圍不過一百八十里。可以空出此地，不修建官舍、民居就行。”御史臨淮人韓牧認為：“可以大致在《禹貢》記載的九河故道處開鑿新河，就算開不出九條，有個四五條，也應該有用。”大司空掾王橫則表示：“黃河注入渤海的地方，比韓牧想開鑿新河處地勢高。以前連續降雨，刮東北風，海水倒灌向西南，淹沒幾百里，九河故地已逐漸被海水侵蝕。大禹治理的黃河河道，本是沿著西山腳下向東北流去。《周譜》記載：‘周定王五年，黃河改道。’可見現在的河道并非大禹所開鑿。而且秦朝攻打魏國時，決黃河水灌魏國都城，決口從此變大，無法修復。應該遷徙百姓到平坦安全之處，重新開鑿河道，讓黃河沿著西山腳下，順著高地向東北流入大海，這樣才能避免水災。”司空掾沛國人桓譚負責審議這些建議，他對甄豐說：“這些方案中，肯定有一個可行，應該詳細考察驗證，就能預見效果。計劃確定后再動工，花費不過幾億錢，還能讓那些沒有產業的閑散百姓有活干。他們閑著也是要官府供給衣食，讓他們干活有收入，是兩全其美之事，既能繼承大禹治水的功績，又能消除百姓的水患。”當時王莽只是推崇這些論，卻并未真正施行。
群臣上奏說：“從前周公攝政七年，制度才確定下來。如今安漢公輔政四年，只用二十天就完成了明堂、辟雍等重大工程，應該將宰衡之位提升到諸侯王之上。”太皇太后下詔：“可以。”并下令商議加九錫的具體辦法。
王莽上奏，尊孝宣皇帝廟為中宗，孝元皇帝廟為高宗；又奏請毀掉孝宣皇帝父親的祭廟，不再修繕；將南陵、云陵改為普通縣。這些奏請都得到批準。
王莽自認為在北方感化了匈奴，在東方使海外諸國來朝，在南方讓黃支國歸附，唯獨西方還未有所建樹，于是派中郎將平憲等人攜帶大量金銀財寶，引誘塞外羌人，讓他們獻出土地，自愿歸屬漢朝。平憲等人上奏：“羌人首領良愿等部落約一萬二千人，愿意成為漢朝臣民，獻出鮮水海、允谷、鹽池，以及平坦肥沃的草地，都供漢民使用；他們自己居住在險要之處，作為漢朝的屏障。詢問良愿歸降的原因，他回答說：‘太皇太后圣明，安漢公極其仁愛，天下太平，五谷豐登，有的稻禾長到一丈多高，有的一粒谷子結出三顆米，有的糧食不種就自己生長，有的蠶繭不用養蠶就能生成；甘露從天而降，甘泉從地下涌出；鳳凰飛來起舞，神雀降落棲息。從這四年以來，羌人沒有任何疾苦，所以一心向往歸屬漢朝。’應該及時安排他們生產生活，設置屬國進行管理。”此事交王莽處理，他又上奏：“如今已有東海郡、南海郡、北海郡，請接受良愿等人獻出的土地，設立西海郡。將天下分為十二個州，以符合古代制度。”奏請得到批準。這年冬天，設立西海郡。王莽又新增五十條法令，違反的人就流放到西海郡。被流放的人數以千萬計，百姓開始心生怨恨。
梁王劉立因與衛氏家族暗中往來獲罪，被廢黜王位，遷徙到南鄭，后來zisha。
朝廷將京城一分為二，設立前輝光、后丞烈兩個郡。更改公卿、大夫、八十一元士的官名、位次，以及十二州的名稱和邊界。各郡國的歸屬、設置和名稱不斷變動，政務繁雜，官吏都難以記住。
元始五年（公元5年）春天正月，在明堂舉行合祭大典；二十八位諸侯王、一百二十位列侯、九百多名宗室子弟，被征召前來助祭。儀式結束后，他們都得到增加封戶、賜爵，以及金帛賞賜，有的晉升官職、補任新職，各有不同。
安漢公王莽又上奏，請求恢復長安南北郊的祭祀。三十多年間，天地祭祀的地點一共變更了五次。
朝廷下詔：“從漢朝建立至今，宗室子弟已有十多萬人，命令各郡國分別設置宗師，負責糾察宗室成員，對他們進行教育訓導。”
夏天四月乙未日，博山簡列侯孔光去世，朝廷賞賜豐厚，葬禮規格極高，送葬的車輛多達一萬多輛。朝廷任命馬宮為太師。官吏百姓因王莽不接受新野田地而上書的，前后共有四十八萬七千五百七十二人，加上進見太后的諸侯王、公卿、列侯、宗室成員，都磕頭進：“應該盡快對安漢公進行嘉獎。”于是王莽上書說：“臣民們所上的奏章，請求都暫時擱置，不要上報，讓我能夠全力完成制定禮樂制度的工作；事情完成后，我希望能告老還鄉，給賢能之人讓路。”甄邯等人稟告太后，太后下詔：“安漢公每次進見，都痛哭流涕、磕頭，說不愿接受賞賜；即便加賞，也不敢居位。如今禮樂制度尚未制定完成，很多事情需要安漢公決定，所以暫且聽從安漢公的意見，完成制度制定；等完成后，眾公卿上報，再對之前的賞賜建議進行詳細討論。關于加九錫的禮儀，要盡快上奏！”
五月，朝廷下策書，賜給安漢公王莽九錫之禮。王莽磕頭再拜，接受了綠色蔽膝、龍袍、冠冕、禮服、玉制佩刀、鞋頭有裝飾的鞋子、天子的車駕和馬匹、繪有龍紋的九旒大旗、皮帽、素色衣裳、兵車和馬匹、紅色和黑色的弓箭、紅色的鉞斧、金色的大斧、一副鎧甲和頭盔、兩卣祭祀用的香酒、兩個玉勺、兩塊九命青玉珪、朱紅色大門、可以登殿的臺階、設置宗官、祝官、卜官、史官，以及三百名虎賁衛士。
王惲等八人巡視風俗歸來，稱天下風俗整齊劃一。他們還偽造各郡國的歌謠，用來歌頌王莽的功德，多達三萬字。閏月丁酉日，朝廷下詔，稱羲和劉秀等四人負責修建明堂、辟雍，使漢朝與周文王建造靈臺、周公營建洛邑一樣符合祥瑞征兆。太仆王惲等八人巡視風俗，宣揚道德教化，使各地整齊劃一，都被封為列侯。當時，只有廣平相班穉沒有上報祥瑞和歌謠；瑯邪太守公孫閎在公府匯報災害情況。甄豐派下屬急馳到這兩個郡，暗示官吏百姓上書彈劾，稱“公孫閎憑空捏造不祥之事，班穉對祥瑞置之不理，嫉害圣明政治，都犯了大逆不道之罪”。班穉是班婕妤的弟弟。太后說：“不宣揚美德，與上報災害的人，處罰應該有所區別。況且班穉出身后宮賢良之家，我很憐惜他。”于是只有公孫閎被投入監獄處死。班穉十分恐懼，上書謝恩認罪，請求歸還相印，入宮擔任延陵園郎；太后答應了他的請求。
王莽又上奏，要實行市場物價統一、官府沒有訴訟、城邑沒有盜賊、野外沒有饑民、路上遺失東西無人拾取、男女分路而行的制度；違反者采用象征性刑罰。
王莽再次上奏說：“共王母（傅太后）、丁姬，從前不遵守臣妾之禮，墳墓高度與元帝的陵墓一樣，還帶著帝太后、皇太太后的璽綬下葬。請求挖掘共王母和丁姬的墳墓，收回璽綬；將共王母遷回定陶，葬在共王墳墓旁邊。”太后認為事情已經過去，不必再發掘。王莽堅持要這么做，太后只好下詔，讓在原棺的基礎上改葬。王莽又奏請：“共王母和丁姬的棺材都是帝王所用的梓宮，穿著珠玉制成的衣服，不符合藩王妾室的規格。請求更換為木棺，脫去珠玉衣，將丁姬葬在妾室的墓地中。”奏請得到批準。朝中在位的公卿都迎合王莽的意思，捐出錢帛，還派遣子弟、儒生以及四方各族共十多萬人，拿著工具，協助將作大匠挖掘鏟平共王母、丁姬的舊墳；二十天內，就全部鏟平。王莽還用荊棘圍繞墓地，作為后世的警戒。他又拆毀共皇廟，當初提議尊崇共皇的泠褒、段猶等人，都被流放到合浦。朝廷征召師丹到公車署，賜爵關內侯，讓他享有原來封邑的食邑。幾個月后，改封師丹為義陽侯；一個多月后，師丹去世。
在漢哀帝的時候，馬宮擔任光祿勛，曾經和丞相、御史一起商量，給傅太后定謚號為孝元傅皇后。后來王莽掌權，開始追查之前參與定謚號的人，要治他們的罪。不過馬宮一直被王莽厚待，所以只有他沒被牽連。但馬宮自己心里又慚愧又害怕，就給朝廷上書說：“我之前參與給定陶共王母（傅太后）定謚號，完全是迎合上面的意思，跟著別人瞎起哄，還歪曲經典，說了一堆歪理，把皇上都給誤導了，這是對朝廷不忠啊！現在我僥幸有機會改過自新，但實在沒臉再留在朝廷，也不想再當官，更不配享受封邑的待遇了。我愿意上交太師、大司徒、扶德侯的印綬，把位置讓給更有才能的人。”